学校设有创新创业学院，持续深化双创教育改革，以体制机制创新为动力，以强化师资队伍建设为重点，以改革人才培养模式为突破，以完善条件和政策保障为支撑，着力推进双创教育与“五育并举、德育为先”深度融合，并贯穿于人才培养全过程、全领域，加快促进学生全面发展，成绩显著，先后10余次在全国及全省高校相关会议上作大会交流发言，荣获国家及省（部）级荣誉表彰30余次。特别是在教育部组织开展的“全国高校实践育人创新创业基地”（首批）、“全国深化创新创业教育改革示范高校”（首批）、“全国创新创业典型经验高校”评选中，武汉生物工程学院实现了这三项荣誉的“大满贯”（同期全国仅有28所高校获得，武汉生物工程学院为全国同类院校唯一）。

近年来，学校涌现出了一批大学生成功创业典型，如，“湖北青年五四奖章”获得者张培文，“四川青年五四奖章”获得者鄢圣敏，“上海市五一劳动奖章”获得者朱会营，“全国乡村振兴青年先锋”“湖北青年五四奖章”获得者王旭，入选第十一届“全国农村青年致富带头人”的许泽坦，创办高新技术企业、两项专利达到国际先进水平、产品远销“一带一路”沿线10余个国家的创业才俊王贤江，创办爱心养老院，获评“全国社区残疾人就业指导服务之星”“湖北百名青年创业榜样”，身残志坚的创业青年宋雄；入选团中央年度创业英雄百强的唐义龙；公司年产值过亿元的青年企业家卜贤超、菅保森、王翡翠、吴勇超等；成功在湖北“青创板”挂牌的创业先锋夏寅辉、罗朝雄、唐长春、李贺、李龙岳等；将专业融入创业，带动农民脱贫致富的爱心青年企业家朱会营、王孝镛；投身公益创业，让近3000名大别山区留守儿童受益的骆群曙等；形成了芬芳绚丽的双创花海。